بررسی میزان تنوع توالی‌های تکرارشونده درسویه های اشریشیا کلی جداشده از منابع آب استان البرز

زمینه و اهداف: اشریشیا کلی (E. coli) باسیل گرم منفی از خانواده انتروباکتریاسه است. باکتری E. coli به‌عنوان شاخص آلودگی آب شهری به فاضلاب استفاده می‌شود. توالی‌های تکرارشونده، تکرارهایی از خود ژن‌ها یا قسمت‌هایی از آن‌ها است که تکرار شده‌اند. تکرارهای پشت سرهم ممکن ازنظر تعداد تکرارها در یک موجود نسبت به سایر جمعیت‌های آن موجود متفاوت باشند، که در اصطلاح به آن‌ها، تکرارهای پشت سرهم با تعداد متغییر می‌گویند. هدف از این مطالعه بررسی میزان تنوع توالی‌های تکرارشونده مربوط به دو لوکوس مهم یعنی ms06 و ms23 در E.coli های جداشده از منابع آب استان البرز است. مواد و روش کار: تعداد 72 ایزوله جداشده E. coli که از مهرماه سال 91 تا مهرماه سال 92، از منابع آب استان البرز جمع‌آوری‌شده بودند موردبررسی قرار گرفت و از آزمون‌های بیوشیمیایی و استاندارد جهت شناسایی و جداسازی باکتری E. coli استفاده شد و پس‌ازآن استخراج ژنوم به‌وسیله روش جوشاندن صورت گرفت. بررسی میزان تنوع توالی‌های تکرارشونده مربوط به دو لوکوس ms06 و ms23 در E.coli با استفاده از روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز انجام گرفت. یافته‌ها: نتایج حاصل از انجام الکتروفورز در 2 لوکوس ms06 و ms23 نشان داد که لوکوس ms06 دارای 5 نوع الل متفاوت (1 تکرار، 2 تکرار، 3 تکرار،4 تکرار، 5 تکرار) و لوکوس ms23 دارای 4 نوع الل متفاوت (1 تکرار، 2 تکرار،5/2 تکرار) می‌باشد و نیز لوکوس ms23، دارای الل null می‌باشد. نتیجه‌گیری: مطالعه حاضر برای اولین بار بر روی E. coli های جداشده از منابع آب استان البرز انجام‌شده است. میزان تنوع توالی‌های تکرارشونده در سویه‌های موردبررسی زیاد بود.